Nella moltitudine di incantevoli cale e insenature da visitare via mare vanno ricordate Cala Core e Punta Bianca, Cala Inferno, Cala dello Schiavone, con l'arco naturale detto Spaccapolpi, Cala Felci, Cala Fonte, Cala Feola, con le sue meravigliose piscine naturali, e i faraglioni di Lucia Rosa. Qui è stata istituita l'Area Naturale Marina Protetta, suddivisa in tre zone (A, B e C) rispettivamente riserva integrale, riserva generale e riserva parziale. La navigazione è consentita solo nella zona C, ossia lungo la costa Est di Ventotene. Consigliamo comunque di chiedere informazioni supplementari, una volta giunti a Ventotene, o di consultare un portolano. A un solo miglio da Ventotene c'è l'isola di Santo Stefano, un grosso scoglio di un paio di chilometri di perimetro, sormontato dal penitenziario borbonico, dove soggiornarono Pertini e l'anarchico Bresci. I simpatici barcaioli ponzesi vi propongono varie escursioni e gite giornaliere alle vicine isole di Palmarola e Zannone o una bellissima escursione subacquea, visto che i fondali dell'isola sono tra i più spettacolari.